Η πρώην μονή του Αγίου Παύλου βρίσκεται κοντά στους Παρανύμφους, σε σημείο όπου υπάρχει πηγή. Τριγύρω βλέπουμε ίχνη από αρχαίο ιερό, που συλήθηκε από αρχαιοκάπηλους.
Σε ένα καταπράσινο τοπίο πάνω από το χωριό Διαβαϊδέ της επαρχίας Πεδιάδος βρίσκεται ο ναός του Αγίου Γεωργίου του Σφακιώτη, που ανάγεται στον 14ο αιώνα. Ο ναός φέρει τοιχογραφίες κάποιου επαρχιώτη ζωγράφου σε πολύ καλή κατάσταση.
Ο σπηλαιώδης ναός της Παναγίας στη Βήθανο βρίσκεται σε πανοραμική τοποθεσία σε μια απόκρημνη πλαγιά του φαραγγιού της Λούτρας, στην περιφέρεια του χωριού Κρότος. Είναι αφιερωμένος στην Ζωοδόχο Πηγή και πάνω από την είσοδο του ναού σώζεται η χρονολογία 20-5-1765, χωρίς όμως να αναφέρεται συγκεκριμένη οικοδομική εργασία.
Το χωριό Σκεπαστή παίρνει το όνομα του από τη δίκλιτη Ενετική εκκλησία της Παναγίας της Σκεπαστής και του Αγίου Νικολάου. Μάλιστα υπάρχει ένας μύθος για την Εκκλησία που αξίζει να αναφέρουμε. Κάποτε πειρατές αποβιβάστηκαν στη Σκεπαστή και αιχμαλώτισαν πολλές κοπέλες, τις οποίες τις πούλησαν ως σκλάβες σε έναν Οθωμανό στη Σμύρνη.
Ανάμεσα στο Αρώνι και στον Αργουλιδέ Ακρωτηρίου Χανίων συναντάμε τον δίκλιτο ναό του Αγίου Αρτεμίου και της Αγίας Παρασκευής. Ο γραφικός αυτός βυζαντινός ναός φαίνεται να χτίστηκε σε δυο φάσεις με το δεξιό κλίτος που ανήκει στην Αγία Παρασκευή να είναι μάλλον το αρχαιότερο. Ανάμεσα στις δύο πόρτες του ο ναός έχει παλιό πηγάδι που συγκέντρωνε το νερό της βροχής ενώ υπάρχει και λαξευτή πέτρινη γούρνα στο φυσικό βράχο.
Ο ναός του Αγίου Γεωργίου στη Σκλαβοπούλα φέρει τοιχογραφίες δύο φάσεων. Οι αρχαιότερες (ιερό και τμήμα βόρειου τοίχου) χρονολογούνται στο 1290, ενώ η δεύτερη φάση (υπόλοιπο τμήμα βόρειου τοίχου και δυτικού τοίχου) χρονολογείται στο 14ο αιώνα.
Στην πλαγιά του βουνού πάνω από το χωριό Μαριού στο νότιο Ρέθυμνο συναντάμε το σπηλαιώδες εκκλησάκι του Άγιου Ονούφριου. Το εκκλησάκι γιορτάζει στις 12 Ιουνίου κάθε χρόνο ημέρα που η εκκλησία μας τιμά τη μνήμη αυτού του τόσο ιδιαίτερου ασκητή της ερήμου. Ένας σχετικά καλός χωματόδρομος που ξεκινά στην είσοδο του χωριού μας οδηγεί στο σημείο που βρίσκεται ο ναός πάνω στο δρόμο. Η θέση του μικρού σπηλαίου που φιλοξενεί το ναό είναι στην ρίζα ενός κοφτού και απότομου κατακόρυφου ασβεστολιθικού βράχου που είναι γεμάτος με ενδημικά χασμόφυτα. Από το σημείο αυτό η θέα στα χωριά της περιοχής και στον κόλπο του Πλακιά είναι μοναδική.
Εδώ βρίσκεται ο μικρός ναός του Αγίου Ονήσιμου, ο μοναδικός που είναι αφιερωμένος στον Άγιο Ονήσιμο στην Ελλάδα (15 Φεβρουαρίου). Ο Άγιος Ονήσιμος ήταν δούλος στη Φρυγία που δραπέτευσε από τον κύριο του για να πάει στη Ρώμη και να συναντήσει τον Απόστολο Παύλο. Θεωρείται ο προστάτης των φυλακισμένων και των δικαστικών.